抵扣联税局认证完之后，将认证相符的专用发票抵扣联、认证结果通知书，认证结果清单，单独装订成册，要单独保管，以备税务稽查。做账时将增值税专用发票记账联贴在凭证后面。用发票抵扣联做账需要注意：如果不隔月，是要将发票联和抵扣联一并退还销售方，销售方可以在防伪税控系统中作废并重新开具正确的发票给你方，账务按正常的程序进行处理。
取得增值税专用发票，抵扣后，做以下分录处理：
借：管理费用/原材料等
贷：应交税费——应交增值税——进项税(发票认证后确认进项税可抵扣)
银行存款/现金
增值税专用发票抵扣联丢失了也是能抵扣认证的。增值税专用发票第二联为抵扣联，是购买方扣税凭证，一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，在丢失前已经认证相符的前提下，可以使用专用发票发票联复印件留存备查，在丢失前未认证的情况下，可以使用专用发票发票联认证，专用发票发票联复印件留存备查。
抵扣联怎么做账务处理
1.取得增值税专用发票，抵扣后，会计分录如下：
借：管理费用/原材料等
贷：应交税费——应交增值税——进项税(发票认证后确认进项税可抵扣)
银行存款/现金
2.发票抵扣的意思是用发票上所载的税额来抵减应交税额，这种情况基本只发生在“增值税”这个税种上。
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说明：因政策不断变化，以上会计实操相关内容仅供参考，如有异议请以官方更新内容为准。